真菌共生與致病性的pH堿化調(diào)控機(jī)制:轉(zhuǎn)錄因子Dal81與Stp2的協(xié)同作用


  市場(chǎng)動(dòng)態(tài)     |      2025-08-25
摘要:研究揭示了轉(zhuǎn)錄因子Dal81與已知調(diào)控因子Stp2的協(xié)同作用機(jī)制。
在人體這個(gè)復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng)中,pH值如同無(wú)形的指揮棒,調(diào)控著微生物的生存策略。對(duì)于機(jī)會(huì)性致病真菌白色念珠菌(Candida albicans)而言,從酸性陰道(pH 4.0)到中性血液(pH 7.4)的跨越,是一場(chǎng)關(guān)乎生死的適應(yīng)性考驗(yàn)。這種真菌不僅要在極端pH環(huán)境中存活,更能主動(dòng)改變周?chē)h(huán)境pH值——這一能力與其從共生狀態(tài)轉(zhuǎn)為致病狀態(tài)密切相關(guān)。然而,盡管已知轉(zhuǎn)錄因子Stp2在環(huán)境堿化中起關(guān)鍵作用,但越來(lái)越多的證據(jù)表明這一過(guò)程還存在其他"幕后推手"。
兩種轉(zhuǎn)錄因子協(xié)同調(diào)控pH堿化促進(jìn)真菌共生與致病性
 圖1 兩種轉(zhuǎn)錄因子協(xié)同調(diào)控pH堿化促進(jìn)真菌共生與致病性
為揭開(kāi)這一謎團(tuán),由Xinhua Huang和Changbin Chen領(lǐng)銜的研究團(tuán)隊(duì)在《Nature Communications》發(fā)表了重要成果。研究人員首先通過(guò)大規(guī)模遺傳篩選,從674個(gè)基因敲除突變體中鑒定出23個(gè)具有堿化缺陷的候選基因,其中編碼Zn(II)2Cys6轉(zhuǎn)錄因子的Dal81表現(xiàn)出與Stp2類(lèi)似的完全堿化能力喪失。通過(guò)構(gòu)建原養(yǎng)型背景的dal81Δ/Δ突變體,研究證實(shí)Dal81缺失會(huì)導(dǎo)致體外和吞噬溶酶體中的堿化缺陷,且與stp2Δ/Δ雙敲除突變體表現(xiàn)出協(xié)同效應(yīng)。
研究采用的主要技術(shù)包括:遺傳篩選(利用C. albicans基因敲除文庫(kù))、蛋白質(zhì)互作分析(酵母雙雜交和免疫共沉淀)、分子生物學(xué)技術(shù)(ChIP-seq和RNA-seq解析轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò))、以及小鼠模型(腸道定植和系統(tǒng)性感染實(shí)驗(yàn))。來(lái)自上海免疫與感染研究所等單位的研究人員還運(yùn)用了先進(jìn)的顯微成像技術(shù)追蹤吞噬體pH動(dòng)態(tài)變化。
Dal81是C. albicans pH堿化的新型調(diào)控因子
研究發(fā)現(xiàn)dal81Δ/Δ突變體在多種培養(yǎng)基(YNB + 1% CAA、人工唾液等)中均喪失堿化能力,表現(xiàn)為培養(yǎng)基顏色變化缺失和氨釋放減少。在巨噬細(xì)胞感染模型中,野生型菌株能有效中和吞噬體pH,而dal81Δ/Δ突變體則持續(xù)保持酸性環(huán)境。
Dal81與Stp2的協(xié)同調(diào)控機(jī)制
通過(guò)酵母雙雜交和Co-IP實(shí)驗(yàn),首次證實(shí)Dal81與Stp2存在物理相互作用。AlphaFold 3預(yù)測(cè)顯示兩者形成"鎖-鑰"結(jié)構(gòu),21個(gè)關(guān)鍵殘基的丙氨酸替換完全破壞了這種互作。值得注意的是,雖然Dal81不影響Stp2的mRNA水平或核定位,但能顯著提高Stp2蛋白穩(wěn)定性。
轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的解析
RNA-seq分析揭示Dal81和Stp2共同調(diào)控2516個(gè)堿化響應(yīng)基因,其中1120個(gè)為兩者共同靶標(biāo)。ChIP-seq證實(shí)兩者協(xié)同結(jié)合于GDH2、PUT1等代謝基因啟動(dòng)子區(qū)。特別值得注意的是,Dal81還特異性調(diào)控糖代謝相關(guān)基因,而Stp2則獨(dú)特調(diào)控氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)基因。
生理功能與致病意義
在形態(tài)發(fā)生方面,dal81Δ/Δ突變體表現(xiàn)出酵母-菌絲轉(zhuǎn)換缺陷,導(dǎo)致巨噬細(xì)胞逃逸能力下降(細(xì)胞毒性降低40%)。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)顯示,dal81Δ/Δ和stp2Δ/Δ單突變體的腸道定植分別減少10倍和8倍,而雙敲除菌株則完全喪失定植能力。系統(tǒng)性感染模型中,雙突變體導(dǎo)致小鼠生存率顯著提高(P<0.0001)。< div="">
白色念珠菌Dal81是pH堿化、菌絲生長(zhǎng)及巨噬細(xì)胞逃逸所必需的
圖2 白色念珠菌Dal81是pH堿化、菌絲生長(zhǎng)及巨噬細(xì)胞逃逸所必需的
這項(xiàng)研究首次闡明了Dal81-Stp2復(fù)合物在真菌環(huán)境適應(yīng)中的核心作用,提出了"協(xié)同調(diào)控"的新模式:Dal81作為分子支架增強(qiáng)Stp2的穩(wěn)定性,兩者共同激活代謝網(wǎng)絡(luò)驅(qū)動(dòng)堿化過(guò)程。這一發(fā)現(xiàn)不僅解釋了為何單獨(dú)回補(bǔ)任一轉(zhuǎn)錄因子無(wú)法挽救堿化表型,更為抗真菌藥物開(kāi)發(fā)提供了新靶點(diǎn)——針對(duì)Dal81-Stp2相互作用界面的小分子抑制劑可能成為選擇性抗真菌劑。
從更廣泛的視角看,該研究揭示了微生物適應(yīng)宿主環(huán)境的精密調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。真菌通過(guò)整合pH感應(yīng)、代謝重編程和形態(tài)轉(zhuǎn)換等多層次調(diào)控,實(shí)現(xiàn)在宿主體內(nèi)的生存擴(kuò)張。這種適應(yīng)性策略很可能是多種病原微生物的共性特征,為理解微生物-宿主互作提供了新范式。未來(lái)研究可進(jìn)一步探索Dal81-Stp2通路與其他環(huán)境感應(yīng)通路(如Rim101)的交叉調(diào)控,以及在臨床菌株中的保守性。
參考資料
[1] Coordinated regulation of pH alkalinization by two transcription factors promotes fungal commensalism and pathogenicity

 

摘要:研究揭示了轉(zhuǎn)錄因子Dal81與已知調(diào)控因子Stp2的協(xié)同作用機(jī)制。
在人體這個(gè)復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng)中,pH值如同無(wú)形的指揮棒,調(diào)控著微生物的生存策略。對(duì)于機(jī)會(huì)性致病真菌白色念珠菌(Candida albicans)而言,從酸性陰道(pH 4.0)到中性血液(pH 7.4)的跨越,是一場(chǎng)關(guān)乎生死的適應(yīng)性考驗(yàn)。這種真菌不僅要在極端pH環(huán)境中存活,更能主動(dòng)改變周?chē)h(huán)境pH值——這一能力與其從共生狀態(tài)轉(zhuǎn)為致病狀態(tài)密切相關(guān)。然而,盡管已知轉(zhuǎn)錄因子Stp2在環(huán)境堿化中起關(guān)鍵作用,但越來(lái)越多的證據(jù)表明這一過(guò)程還存在其他"幕后推手"。
兩種轉(zhuǎn)錄因子協(xié)同調(diào)控pH堿化促進(jìn)真菌共生與致病性
 圖1 兩種轉(zhuǎn)錄因子協(xié)同調(diào)控pH堿化促進(jìn)真菌共生與致病性
為揭開(kāi)這一謎團(tuán),由Xinhua Huang和Changbin Chen領(lǐng)銜的研究團(tuán)隊(duì)在《Nature Communications》發(fā)表了重要成果。研究人員首先通過(guò)大規(guī)模遺傳篩選,從674個(gè)基因敲除突變體中鑒定出23個(gè)具有堿化缺陷的候選基因,其中編碼Zn(II)2Cys6轉(zhuǎn)錄因子的Dal81表現(xiàn)出與Stp2類(lèi)似的完全堿化能力喪失。通過(guò)構(gòu)建原養(yǎng)型背景的dal81Δ/Δ突變體,研究證實(shí)Dal81缺失會(huì)導(dǎo)致體外和吞噬溶酶體中的堿化缺陷,且與stp2Δ/Δ雙敲除突變體表現(xiàn)出協(xié)同效應(yīng)。
研究采用的主要技術(shù)包括:遺傳篩選(利用C. albicans基因敲除文庫(kù))、蛋白質(zhì)互作分析(酵母雙雜交和免疫共沉淀)、分子生物學(xué)技術(shù)(ChIP-seq和RNA-seq解析轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò))、以及小鼠模型(腸道定植和系統(tǒng)性感染實(shí)驗(yàn))。來(lái)自上海免疫與感染研究所等單位的研究人員還運(yùn)用了先進(jìn)的顯微成像技術(shù)追蹤吞噬體pH動(dòng)態(tài)變化。
Dal81是C. albicans pH堿化的新型調(diào)控因子
研究發(fā)現(xiàn)dal81Δ/Δ突變體在多種培養(yǎng)基(YNB + 1% CAA、人工唾液等)中均喪失堿化能力,表現(xiàn)為培養(yǎng)基顏色變化缺失和氨釋放減少。在巨噬細(xì)胞感染模型中,野生型菌株能有效中和吞噬體pH,而dal81Δ/Δ突變體則持續(xù)保持酸性環(huán)境。
Dal81與Stp2的協(xié)同調(diào)控機(jī)制
通過(guò)酵母雙雜交和Co-IP實(shí)驗(yàn),首次證實(shí)Dal81與Stp2存在物理相互作用。AlphaFold 3預(yù)測(cè)顯示兩者形成"鎖-鑰"結(jié)構(gòu),21個(gè)關(guān)鍵殘基的丙氨酸替換完全破壞了這種互作。值得注意的是,雖然Dal81不影響Stp2的mRNA水平或核定位,但能顯著提高Stp2蛋白穩(wěn)定性。
轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的解析
RNA-seq分析揭示Dal81和Stp2共同調(diào)控2516個(gè)堿化響應(yīng)基因,其中1120個(gè)為兩者共同靶標(biāo)。ChIP-seq證實(shí)兩者協(xié)同結(jié)合于GDH2、PUT1等代謝基因啟動(dòng)子區(qū)。特別值得注意的是,Dal81還特異性調(diào)控糖代謝相關(guān)基因,而Stp2則獨(dú)特調(diào)控氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)基因。
生理功能與致病意義
在形態(tài)發(fā)生方面,dal81Δ/Δ突變體表現(xiàn)出酵母-菌絲轉(zhuǎn)換缺陷,導(dǎo)致巨噬細(xì)胞逃逸能力下降(細(xì)胞毒性降低40%)。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)顯示,dal81Δ/Δ和stp2Δ/Δ單突變體的腸道定植分別減少10倍和8倍,而雙敲除菌株則完全喪失定植能力。系統(tǒng)性感染模型中,雙突變體導(dǎo)致小鼠生存率顯著提高(P<0.0001)。< div="">
白色念珠菌Dal81是pH堿化、菌絲生長(zhǎng)及巨噬細(xì)胞逃逸所必需的
圖2 白色念珠菌Dal81是pH堿化、菌絲生長(zhǎng)及巨噬細(xì)胞逃逸所必需的
這項(xiàng)研究首次闡明了Dal81-Stp2復(fù)合物在真菌環(huán)境適應(yīng)中的核心作用,提出了"協(xié)同調(diào)控"的新模式:Dal81作為分子支架增強(qiáng)Stp2的穩(wěn)定性,兩者共同激活代謝網(wǎng)絡(luò)驅(qū)動(dòng)堿化過(guò)程。這一發(fā)現(xiàn)不僅解釋了為何單獨(dú)回補(bǔ)任一轉(zhuǎn)錄因子無(wú)法挽救堿化表型,更為抗真菌藥物開(kāi)發(fā)提供了新靶點(diǎn)——針對(duì)Dal81-Stp2相互作用界面的小分子抑制劑可能成為選擇性抗真菌劑。
從更廣泛的視角看,該研究揭示了微生物適應(yīng)宿主環(huán)境的精密調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。真菌通過(guò)整合pH感應(yīng)、代謝重編程和形態(tài)轉(zhuǎn)換等多層次調(diào)控,實(shí)現(xiàn)在宿主體內(nèi)的生存擴(kuò)張。這種適應(yīng)性策略很可能是多種病原微生物的共性特征,為理解微生物-宿主互作提供了新范式。未來(lái)研究可進(jìn)一步探索Dal81-Stp2通路與其他環(huán)境感應(yīng)通路(如Rim101)的交叉調(diào)控,以及在臨床菌株中的保守性。
參考資料
[1] Coordinated regulation of pH alkalinization by two transcription factors promotes fungal commensalism and pathogenicity